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Text File  |  1995-03-04  |  1.1 KB  |  24 lines
  1. ********************************************
  2. * Aromatic amino acids permeases signature *
  3. ********************************************
  4.  
  5. It has been shown [1] that some proteins involved in the transport of aromatic
  6. amino acids in Escherichia coli are evolutionary related; these permeases are:
  7.  
  8.  - The tryptophan-specific transport protein (tryptophan permease) (gene mtr).
  9.  - The low affinity tryptophan permease (gene tnaB or trpP).
  10.  - The tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease) (gene tyrP).
  11.  
  12. These permeases are proteins of  about 400 to 410 amino  acids  which probably
  13. contain 11 or 12 transmembrane regions. The best conserved domain is a stretch
  14. of 10 residues which seems to be  located  in a cytoplasmic  loop  between the
  15. eight and ninth transmembrane region.
  16.  
  17. -Consensus pattern: G-V-[GSTA]-[LIV]-G-L-F-D-Y-[LIV]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: December 1992 / Pattern and text revised.
  21.  
  22. [ 1] Sarsero J.P., Wookey P.J., Gollnick P., Yanofsky C., Pittard A.J.
  23.      J. Bacteriol. 173:3231-3234(1991).
  24.